La exposición permanente del Josephinum exhibe sus ricas colecciones en siete salas en la primera planta, dedicadas a los modelos de cera anatómicos de fama mundial comprados por el emperador José II. La planta baja destaca el desarrollo de la medicina desde el siglo XIX, incluyendo sus períodos más oscuros, y aborda la medicina de alta tecnología y la bioética modernas.
El Josephinum presenta con orgullo su extensa exposición permanente, que ofrece una inmersión profunda en la historia de la medicina, con un enfoque particular en las contribuciones de Viena. La primera planta está dedicada a los renombrados modelos de cera anatómicos, adquiridos originalmente por el emperador José II, expuestos en su contexto histórico. Esta sección también explora la historia del propio edificio del Josephinum durante el siglo XVIII.
Como complemento, la planta baja sirve como almacén de colecciones universitarias y espacio expositivo flexible. Se centra en objetos y temas relacionados con la evolución de la medicina a partir del siglo XIX, abordando críticamente períodos como el nacionalsocialismo y cuestiones contemporáneas como la medicina de alta tecnología y la bioética. Los visitantes pueden descubrir magníficos objetos históricos, instrumentos, imágenes, documentos y libros, muchos de los cuales se muestran al público por primera vez. Entre los aspectos más destacados se encuentran instrumentos quirúrgicos encargados por Giovanni Alessandro Brambilla, el primer endoscopio del mundo desarrollado por Philipp Bozzini, el cráneo de Franz Joseph Gall, un currículum manuscrito de Sigmund Freud y el expediente relacionado con el asesinato de la emperatriz Elisabeth.